В начале смены оператор принимает оборудование, проверяет записи в журналах и показания контрольно-измерительных приборов. Обходит сооружения, оценивает работу оборудования и насосов, состояние трубопроводов и уровень загрязнения фильтров. При обнаружении неполадок вызывает ремонтную службу. В течение смены оператор контролирует процесс очистки воды по этапам. Отбирает пробы для анализа, регулирует подачу реагентов и следит за работой систем аэрации. Каждые два часа проверяет состав очищенной воды — содержание примесей не должно превышать установленных норм. При аварийных ситуациях оператор переключает потоки воды на резервные линии, останавливает неисправное оборудование и принимает меры по локализации загрязнений. Оператор ведёт оперативный журнал, фиксирует все отклонения в работе и передаёт информацию руководству станции. Также в его обязанности входит обслуживание и ремонт оборудования: регулярное техническое обслуживание насосов, фильтров, аэраторов, септиков и других установок, используемых в процессе очистки, а также оперативное устранение неисправностей. Контроль за химическими реагентами: подготовка и использование химических веществ, необходимых для процессов очистки, в правильных пропорциях и безопасных условиях.